Кафедра анатомии человека вначале располагалась на втором этаже здания бывшей мужской гимназии (в настоящее время - II корпус БГМУ). В 1933 году она перемещена в отдельное двухэ­тажное здание, в котором до Октябрьской революции жили препо­даватели гимназии. В начале 50-х годов XX столетия по инициативе и под руководством заведующего кафедрой профессора С.З. Лукманова, работавшего тогда одновременно министром здравоохране­ния БАССР, была сделана надстройка III этажа. В этот же период рядом со зданием кафедры было построено трупохранилище. В 1970 г. к кафедре сделан пристрой, который соединил трупохранилище с первым этажом здания, что значительно облегчило перемещение трупного материала в учебные залы, особенно в зимнее время. В строительстве пристроя принимали участие студенты и препода­ватели кафедры. Особую активность при этом проявил доцент В.В. Кузнецов.

     В эти же годы осуществлена реконструкция трупохранилища: увеличена его площадь, проведены работы по устранению затопле­ния грунтовыми водами, смонтированы водопроводная, канализа­ционная и вентиляционная системы, установлены подъемные чаны и настенные шкафы.

     В начале 70-х годов XX столетия расширена костная лаборато­рия с 12 кв.м. до 26 кв.м. за счет соединения двух смежных комнат и в ней увеличено количество стеллажей и шкафов. В эти же годы оптимизированы условия для научной работы. В 1967 г. на кафедре была организована гистологическая лаборатория с закреплением трех штатных единиц лаборантов (Адельметова Г.С., Хлестова Н.А, Сиразетдинова Н.И.). В 1970 г. создана фотолаборатория, которой со дня ее организации заведует В.Н. Зайцев. Фотолаборатория стала, по существу, базой для изготовления слайдов и микрофотоснимков для всего БГМУ.

     В 1995 г. и в 1999 г. проведена реконструкция помещения кафед­ры. После реконструкции 1995 г. анатомический музей размещен в изолированном зале III этажа с площадью около 130 кв.м.; улучше­ны условия работы преподавателей кафедры - они перемещены в кабинеты III этажа. Реконструкция здания 1999 года коснулась I и  II этажей: деревянное перекрытие между ними заменено на желе­зобетонное; четыре секционных зала первых двух этажей разделены на 10 учебных комнат - отдельных для каждой группы. В результате этого на I этаже разместились 5 учебных комнат, костная и фотола­боратории, комната старшего (хозяйственного) лаборанта; на II этаже - 4 учебные комнаты, компьютерный класс, класс ТСО, гисто­логическая лаборатория, научная лаборатория аспирантов и лабо­ратория микроскопирования. Стены и полы учебных комнат и ла­бораторий выложены кафельными плитами. Все учебные комнаты оборудованы заказанной специально учебной мебелью, чаном из не­ржавеющей стали, подключенным к водопроводной и канализаци­онной сетям, столом-каталкой. Каждая комната имеет автономные приточную и вытяжную вентиляции.

     Реконструкция трупохранилища планируется в ближайшее время.